سلوک پیوسته و دائمی مرحوم علامه مصباح یزدی، سلوکی اخلاقی و عرفانی بود. ایشان علاوه بر اهتمام شخصی به حرکت در مسیر اخلاق و عرفان، دغدغه­ی اخلاقی­سازی و عرفان محور کردنِ افراد جامعه -به ویژه جوانان - را داشتند. اسامی برخی از کتابهای استاد در حوزه مباحث «اخلاقی و عرفانی» به شرح پیش‌رو است: یاد او؛ بر درگاه دوست؛ خودشناسی برای خودسازی؛ به سوی تو؛ انسان سازی در قرآن؛ به سوی او؛ در جستجوی عرفان اسلامی؛ و ...

انس و علاقه مرحوم علامه مصباح یزدی به روایات اهل بیت (علیهم السلام) و حجت دانستن سیره‌ی آن بزرگان، باعث شده بود که محور اصلی بسیاری از مباحث ایشان، سخن و سیره معصومین (علیهم السلام) باشد. اسامی برخی از کتابهای استاد در حوزه مباحث ، «سخن و سیره معصومین» (علیهم السلام) به شرح پیش‌رو است: آذرخشی دیگر از آسمان کربلا؛ راهیان کوی دوست؛ پندهای الهی؛ آفتاب ولایت؛ جامی از زلال کوثر؛ شکوه نجوا؛ پند جاوید؛ ره توشه؛ رستگاران؛ و ...

تسلط مرحوم علامه مصباح یزدی به تُراث عقلی عالَم اسلام و غرب، و قدرت تحلیل ایشان، از آن شخصیت بزرگ فیلسوفی متبحر و نوآور پدید آورده بود. همچنین پیوند ایشان با مباحث کلامی جدید و قدیم، باعث شد که ایشان در زمره بزرگترین متکلمان تاریخ اسلامی قرار گیرد. اسامی برخی از کتابهای استاد در حوزه مباحث «کلام و فلسفه دین» به شرح پیش‌رو است: آموزش عقائد؛ نقش تقلید در زندگی انسان؛ تعدد قرائت­ها؛ چکیده­ای از اندیشه­های بنیادین؛ در پرتو ولایت؛ آموزش عقاید؛ و ...

از جمله مباحثی که به صورتی جدّی در دوران معاصر در مجامع علمی دنیا مطرح است گفتگو پیرامون فلسفه‌های مضاف می باشد. مرحوم علامه مصباح یزدی به واسطه بهره­مندی از معارف اصیل و ناب اسلامی، در حوزه­های مختلف فلسفه­ی مضاف به ایراد بحث پرداخته­ و مباحث عمیق و نوینی را ارائه نموده­اند. اسامی برخی از کتابهای استاد در حوزه مباحث «کلام و فلسفه دین» به شرح پیش‌رو است: حکیمانه ترین حکومت؛ پرسش­ها و پاسخ­ها؛ رابطه علم و دین؛ نگاهی گذرا به حقوق بشر؛ جامعه و تاریخ از دیدگاه قرآن؛ نظریه سیاسی اسلام؛ نظریه حقوقی اسلام؛ و ...